麝香鼠適應性很強，對溫度、濕度要求并非十分嚴格，它們可以在南方多濕溫暖、甚至高溫炎熱的地區落戶，也可以在中國寒冷的東北、干旱的西北地區生存繁殖。麝香鼠住在濕地，包括池塘、湖、沼澤及河岸，因而得到"沼澤松鼠"的昵稱。它們是很好的游泳者，在水中，它們用自己的尾巴推進。雖然它們像海貍，但它們的尾巴較海貍皮革般的尾巴小和瘦。它們出沒于阿拉斯加、加拿大及北墨西哥。麝香鼠會在水源旁挖掘出很大的地道的系統，并在水底做一個入口。在沼澤，麝香鼠會用香蒲和泥來建造它們的巢穴，甚至輸送食物的平臺。住在海貍巢穴的麝香鼠也很常見。麝香鼠幫忙維持給予水生動物提供棲息地方的沼澤空地。

麝香鼠的形態雖適宜游泳和潛水，但在陸地上，卻移動極不靈活，因此它們多在黃昏和夜晚活動。它們起居的水體，常出現被咬斷后漂浮在水面的植物，在岸邊它們通過的跑道附近，有20-30mm長的深綠色糞便，堆放成堆。